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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  27 lines
  1. ******************************************************************
  2. * Cytochrome c oxidase assembly factor COX10/ctaB/cyoE signature *
  3. ******************************************************************
  4.  
  5. Cytochrome c oxidase is an oligomeric enzymatic complex which seems to require
  6. a number of subunits that either act as chaperonins  to  help  the subunits of
  7. the enzyme to fold correctly, or that may assist  in the assembly of the metal
  8. centers [1].  One of these subunits is known as COX10 in yeast and as ctaB [2]
  9. in aerobic prokaryotes.  It is evolutionary related  to  the cyoE protein from
  10. the Escherichia coli cytochrome O terminal oxidase complex.
  11.  
  12. These proteins  probably  contain  [3]  seven transmembrane segments; the best
  13. conserved region  is  located  in a loop between the second and third of these
  14. segments. We have used this region as a signature pattern.
  15.  
  16. -Consensus pattern: [ED]-x(2)-M-x-R-T-x(2)-R-x(4)-G
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: June 1994 / First entry.
  20.  
  21. [ 1] Nobrega M.P., Nobrega F.G., Tzagoloff A.
  22.      J. Biol. Chem. 265:14220-14226(1990).
  23. [ 2] Cao J., Hosler J., Shapleigh J., Revzin A., Ferguson-Miller S.
  24.      J. Biol. Chem. 267:24273-24278(1992).
  25. [ 3] Chepuri V., Gennis R.B.
  26.      J. Biol. Chem. 265:12978-12986(1990).
  27.